Primero si actualizas a la 4.1 deberas reinstalar todo de nuevo, incluyendo tu informacion personal, apps y todo lo referente a cydia (puedes sincronizar con itunes y guardar toda tu informacion, apps y puedes usar aptbackup de cydia para guardar todo lo referente a cydia), ademas tu baseband se actualizara por lo que no podras usar tu idevice con otras carriers (companias telefonicas no aprobadas por apple), todas las funciones de tu idevice seguiran funcionando como hasta ahora, si decides subir a la oficial 4.1 puedes usar el limera1n o greenpois0n (no existe diferencia), ahora te recomiendo que uses el pwnage tool 4.1 (solo disponible para Mac OS) para que realices un custom firmware  del iOS 4.1 (trae el jailbreak ya listo desde el iOS asi no tendras que usar ningun otro metodo jailbreak) y asi no actualices la baseband de tu idevice y tengas la oportunidad de seguir liberando la SIM de idevic